5-фторурацил используется для нанесения на кожу в виде крема при лечении актинического (солнечного) кератоза и базальноклеточной карциномы (базалиомы), которые возникают вследствие хронического воздействия лучей солнца и солнечных ожогов.

Поскольку актинический кератоз часто трансформируется в плоскоклеточный рак кожи использование 5-фторурацила в его лечении может иметь онкопрофилактическое значение.